現時香港承辦口岸接駁功能的路線由B線(路線編號以B開首)的路線擁有，用以連接各個口岸關卡如深圳灣(B3,B3M,B3X)，福田(B1),香園圍(計劃開辦的B7,B8,B9)，以下會提及的港珠澳大橋(B4,B5,B6)。從定位上看，各B線都是由接近邊境口岸的地區，新市鎮連接各個邊境口岸，如要由市區啟程，若不選擇直通巴士或港鐵(羅湖及福田)，要乘車前往那些地區再轉車前往。雖然該等口岸線會與連接市區的路線有轉乘優惠，但始終帶行李轉車在乘客角度而言並不方便。自從港珠澳大橋於上年10月開通，口岸也同時啟用，城巴及龍運將部份以機場地面運輸中心為總站的A線繞經人工島上的口岸交通交匯處，定線為1號客運大樓>2號客運大樓>口岸>機場地面運輸中心。然而這樣的定線引起問題。
#1:時間問題
現時部份A線往機場方向在停靠2號客運大樓後要經赤鱲角路後再在人工島口岸繞圈後再前往地面運輸中心，巴士公司預計要花多十分鐘。對於前往客運大樓辦理登機離境手續而言問題不大，可能只需在市區花時間在等侯上落前往口岸的乘客，但若然是前往地面運輸中心便需額外多花時間。往市區方向問題便會出現，因為根據過往定線，往市區方向A線並不在1號及2號客運大樓設站，在地面運輸中心上客後便直接離開赤鱲角前往青嶼幹線收費廣場。因此現在繞經口岸，機場往市區乘客仍舊在地面運輸中心上車，但仍需多花時間在繞經口岸上，先經赤鱲角路再停口岸最後經南面連接路(順朗路)再出青嶼幹線，比起昔日直接離開赤鱲角路線更顯迂迴，故此被乘客及交通關注組評擊做法多此一舉。然而，在司機上比乘客上更突顯出時間上的問題，本身機場A線行車時間長，動輒1-2個小時，部份司機在1號及2號客運大樓清客後仍需在前往口岸落疾7客再前往地面運輸中心，為長的駕駛時間百上加斤。
#2:客量及運載力問題
港珠澳大橋香港口岸為繞經人工島的A線帶來客源。惟先經機場再經大橋口岸的安排會令現行A線的班次字軌用車同時需上兩批乘客，令車廂擠迫情況加劇，加上旅遊高峰期，旺季時因車廂容量與乘客數目比例僧多粥少，嚴重降低路線運載力。與此同時，路線的效率及服務質素亦會相應降低。
建議#1:港珠澳大橋與機場分家
建議現行A車可分拆出BA線，與現有計劃中的BA31及BA41和A11T(北角碼頭至機場地面運輸中心)不同，本建議的BA線是以港珠澳大橋香港口岸為總站，在總站前停旅檢大樓站，並不繼續前往機場。最大用處是將現有機場客與口岸客分流，機場客可繼續乘搭A線而口岸客乘搭BA線，此建議可解決現有A線時間上及運載力，服務質素，效率上的問題，因為分拆出BA線後,A線可繼續維持大橋旅檢大樓啟用前的走線,停靠2號客運大樓後可直接前往地面運輸中心，而往市區或新市鎮方向可在停靠地面運輸中心後直接離開赤鱲角。此舉亦可令A線及BA線的角色更鮮明。
BA31 如心廣場<>港珠澳大橋香港口岸
按現有A31線至北大嶼山公路後經順朗路前往口岸
往:港珠澳大橋香港口岸
大河道、沙咀道、大涌道、青山公路 – 荃灣段、荃景圍、美環街、愉景新城巴士總站、美環街、西樓角路、大河道、青山公路 – 荃灣段、城門道、西樓角路、蕙荃路、廟崗街、城門道、關門口街、聯仁街、馬頭壩道、德士古道、荃青交匯處、青荃路、担杆山交匯處、青敬路、長安巴士總站、担杆山路、担杆山交匯處、青衣北岸公路、青衣西北交匯處、青嶼幹線、北大嶼山公路、順朗路、赤鱲角路、順暉路及順匯路
1.如心廣場
2.福來邨
3.愉景新城
4.荃灣站
5.眾安街
6.綠楊新邨
7.悅來酒店
8.聯仁街
9.馬頭壩道
10.龍德街
11.長安邨
12.青嶼幹線收費廣場
13.港珠澳大橋旅檢大樓
14.港珠澳大橋香港口岸
往:如心廣場
順匯路、赤鱲角路、順朗路、北大嶼山公路、青嶼幹線、青衣西北交匯處、青衣北岸公路、担杆山交匯處、青敬路、長安巴士總站、担杆山路、担杆山交匯處、青荃路、荃青交匯處、德士古道、馬頭壩道、聯仁街、關門口街、城門道、西樓角路、蕙荃路、廟崗街、城門道、青山公路 – 荃灣段、西樓角路、美環街、愉景新城巴士總站、美環街、荃景圍、青山公路 – 荃灣段、大涌道、迴旋處、大涌道、沙咀道及大河道
1.港珠澳大橋香港口岸
2.青嶼幹線收費廣場
3.長安邨
4.龍德街
5.聯仁街
6.仁濟醫院
7.綠楊新邨
8.眾安街
9.富華街
10.永康樓
11.愉景新城
12.祈德尊新村
13.滿樂大廈
14.如心廣場
BA41 愉翠苑<>港珠澳大橋香港口岸
按現有A41線至北大嶼山公路後經順朗路前往口岸
往:港珠澳大橋香港口岸
牛皮沙街、插桅杆街、銀城街、小瀝源路、大涌橋路、獅子山隧道公路、沙田正街、白鶴汀街、沙田正街、橫壆街、源禾路、沙田鄉事會路、大埔公路 – 沙田段、城門隧道公路、城門隧道、象鼻山路、荃錦交匯處、德士古道北、德士古道、青荃橋、青衣北岸公路、青衣西北交匯處、青嶼幹線、北大嶼山公路、順朗路、赤鱲角路、順暉路及順匯路
1.愉翠苑
2.愉田苑
3.置富第一城
4.沙田第一城
5.富豪花園
6.麗豪酒店
7.乙明邨
8.文化博物館
9.帝都酒店
10.希爾頓中心
11.沙田市中心
12.好運中心
13.青嶼幹線收費廣場
14.港珠澳大橋旅檢大樓
15.港珠澳大橋香港口岸
往:愉翠苑
順匯路、赤鱲角路、順朗路、北大嶼山公路、青嶼幹線、青衣西北交匯處、青衣北岸公路、青荃橋、德士古道、德士古道北、象鼻山路、城門隧道、城門隧道公路、大埔公路 – 沙田段、沙田鄉事會路、大埔公路 – 沙田段、沙田市中心巴士總站、沙田正街、白鶴汀街、沙田正街、獅子山隧道公路、大涌橋路、小瀝源路、銀城街、插桅杆街、牛皮沙街及翠欣街
1.港珠澳大橋香港口岸
2.青嶼幹線收費廣場
3.沙田市中心
4.帝都酒店
5.文化博物館
6.曾大屋
7.乙明邨
8.麗豪酒店
9.富豪花園
10.置富第一城
11.愉田苑
12.第一城站
13.愉翠苑
建議#2:開辦B5A線由青嶼幹線收費廣場至港珠澳大橋香港口岸
由於現時往港珠澳大橋香港口岸的B線並未能覆蓋青嶼幹線收費廣場,惟該處是主要轉車站,故此為方便現時沒有港珠澳大橋香港口岸巴士覆蓋的地區提供在東涌線/迪士尼線欣澳站轉乘B5線外的轉乘服務，建議開辦B5A青嶼幹線收費廣場<>港珠澳大橋香港口岸，可靠轉乘方法解決現有A線繞經口岸在走線及時間上的問題。
B5A 青嶼幹線收費廣場<>港珠澳大橋香港口岸
往:港珠澳大橋香港口岸
青嶼幹線收費廣場、北大嶼山公路、順朗路、赤鱲角路、順暉路及順匯路
1.青嶼幹線收費廣場
2.港珠澳大橋旅檢大樓
3.港珠澳大橋香港口岸
往:青嶼幹線收費廣場
順匯路、赤鱲角路、順朗路、北大嶼山公路及青嶼幹線收費廣場
1.港珠澳大橋香港口岸
2.青嶼幹線收費廣場
建議#3:提供跨公司轉乘優惠
由於現時A線或E線與B線(B4,B5,B6)之間並無轉乘優惠，而龍運A/E線轉乘建議2的城巴B5A,城巴A/E線轉乘嶼巴B4/B6及龍運A/E線轉乘嶼巴B4/B6的方法可以為乘客提供更多前往口岸的選擇，增加轉乘組合，加強轉乘網絡。
建議轉乘組合: 龍運/城巴A/E線<>B5A
龍運/城巴E線<>嶼巴B4/B6
龍運/城巴E線<>城巴S56/龍運S64<>嶼巴B4
對象:青嶼幹線收費廣場>港珠澳大橋香港口岸
轉往路線:B5A
優惠車資:城巴(免費)，龍運(B5A原車資減60%)
轉乘地點:青嶼幹線收費廣場
對象:東涌>港珠澳大橋香港口岸
轉往路線:B6/S56/S64
建議#4:加密各B線班次
建議#5:案使用量篩選入口岸A線
建議#6:新界西A線可在日後屯門赤鱲角連接路通車後取道此路前往口岸
日後通車的屯門赤鱲角連接路由屯門西繞道通往港珠澳大橋香港口岸，新界西A車經屯門赤鱲角繞道較現時經屯門公路及青嶼幹線較為快捷，建議新界西A線可在日後屯門赤鱲角連接路通車後取道此路前往口岸
建議好處:保障乘客時間及其行李安全
現時有議員及交通關注組指出現時繞經口岸的A線因需額外接載口岸乘客令客流增加，最終行李架經常放滿，甚至出現拿錯行李或行李亂放的亂況。而開辦BA線分流口岸與機場乘客可減少用在處理消化口岸乘客所需的時間。而建議BA31及BA41取消前往機場的做法令A線專注做機場客生意，BA線專注做口岸客生意可保障乘客能有穩定的出行時間，減少花時間在乘車上。解決了現有A線先機場後口岸及BA線先口岸後機場在走線及時間上的問題。另一方面，因為A車做少一批口岸客，加上行李架附近閉路電視的監控，在旅遊淡季或客量較少的時段或許會減少行李被調包的情況。